农民合同工与正式工存在差异。依据《劳动法》等相关规定，正式工需办理正式手续，有固定工期及考核要求。不及时明确身份，可能影响权益保障，如工资、福利等。
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处理农民合同工与正式工差异，常见方式为明确合同内容、了解各自权益。根据具体情况，选择适用劳动法规定，或咨询专业律师以确保合法权益。
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农民合同工与正式工不同。具体操作：1. 明确合同性质，了解自身身份；2. 对照《劳动法》等法规，确认权益；3. 遇争议，及时与雇主沟通或寻求法律援助，确保权益不受损。